Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT1O43278 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms