Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 59.99□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 59.99□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 58.6□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 27.79□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-211ENST00000557643 872 ntTSL 33.1□□□□□ -1.911e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-207ENST00000554090 543 ntTSL 52.37□□□□□ -2.031e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.041e-8■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 214.83□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 30.6
RBFOX2O43251 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-218ENST00000485932 553 ntTSL 415.74■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-208ENST00000441840 1854 ntTSL 515.52■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-206ENST00000439983 615 ntTSL 415.01□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-215ENST00000458579 662 ntTSL 314.86□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-209ENST00000441904 878 ntTSL 314.66□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-205ENST00000439815 561 ntTSL 414.25□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-216ENST00000464762 693 ntTSL 514.25□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-222ENST00000498733 1401 ntTSL 214.24□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-201ENST00000411855 1447 ntTSL 214.1□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-203ENST00000429716 1622 ntTSL 213.9□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 DBNL-202ENST00000423561 634 ntTSL 211.01□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 ZNF292-208ENST00000518845 277 ntTSL 316.03■□□□□ 0.164e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 ZNF292-203ENST00000369578 1732 ntTSL 214.07□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 310.73□□□□□ -0.696e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.416e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.536e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 SLC39A14-207ENST00000518348 1086 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 AMDHD2-212ENST00000566706 940 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-10■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 AMDHD2-209ENST00000563633 1117 ntTSL 516.26■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.041e-10■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 AMDHD2-205ENST00000563145 859 ntTSL 214.71□□□□□ -0.051e-10■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 AMDHD2-206ENST00000563444 529 ntTSL 210.83□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 AMDHD2-204ENST00000561487 701 ntTSL 210.79□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 GALNT1-206ENST00000591924 542 ntTSL 316.5■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 PNCK-218ENST00000462280 704 ntTSL 314.97□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 GALNT1-202ENST00000586725 272 ntTSL 510.55□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 IMMP2L-208ENST00000487733 580 ntTSL 23.81□□□□□ -1.81e-8■■■■■ 30.5
RBFOX2O43251 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-207ENST00000459957 873 ntTSL 215.74■□□□□ 0.118e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.338e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-210ENST00000464241 1562 ntTSL 1 (best)12.92□□□□□ -0.348e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-208ENST00000463189 894 ntTSL 312.08□□□□□ -0.488e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-213ENST00000464953 627 ntTSL 311.63□□□□□ -0.558e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-206ENST00000449459 2161 ntTSL 211.23□□□□□ -0.618e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.818e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 59.81□□□□□ -0.848e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-204ENST00000424122 2806 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.898e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.018e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.038e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-213ENST00000491252 3860 ntTSL 28.49□□□□□ -1.058e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.068e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-202ENST00000410003 3358 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.088e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 TTC31-212ENST00000489152 4025 ntTSL 28.14□□□□□ -1.118e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.158e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 MGME1-205ENST00000467391 740 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 MGME1-204ENST00000463219 571 ntTSL 36.91□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.338e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-210ENST00000529826 2423 ntTSL 56.75□□□□□ -1.333e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-216ENST00000532384 3237 ntTSL 55.96□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-208ENST00000528229 573 ntTSL 25.64□□□□□ -1.518e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 LPIN1-210ENST00000454151 583 ntTSL 34.98□□□□□ -1.618e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.683e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.783e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.83e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-219ENST00000534269 4239 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.853e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.893e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-212ENST00000530429 3167 ntTSL 52.84□□□□□ -1.953e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.993e-9■■■■■ 30.4
RBFOX2O43251 BCLAF1-206ENST00000527613 5640 ntTSL 1 (best)2.61□□□□□ -1.993e-9■■■■■ 30.4
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 322.2 ms