Protein–RNA interactions for Protein: O43182

ARHGAP6, Rho GTPase-activating protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP6O43182 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP6O43182 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP6O43182 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms