Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM6AO15550 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM6AO15550 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms