Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARPC5O15511 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARPC5O15511 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms