Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGRMC1O00264 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRMC1O00264 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms