Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
C6orf229H3BNL8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C6orf229H3BNL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms