Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms