Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PBE3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E9PBE3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E9PBE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9PBE3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9PBE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9PBE3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E9PBE3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PBE3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PBE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PBE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PBE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PBE3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PBE3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PBE3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PBE3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E9PBE3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PBE3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms