Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCRIP1C9JLW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MCRIP1C9JLW8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms