Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HHLA1C9JL84 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms