Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms