Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL13PA6NNM8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL13PA6NNM8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms