Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD3A6NKT7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD3A6NKT7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD3A6NKT7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms