Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC69A6NI79 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms