Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms