Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L3A6NCW0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L3A6NCW0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L3A6NCW0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 677.9 ms