Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms