Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms