Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Epb41l1Q9Z2H5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l1Q9Z2H5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb41l1Q9Z2H5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epb41l1Q9Z2H5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epb41l1Q9Z2H5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epb41l1Q9Z2H5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epb41l1Q9Z2H5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epb41l1Q9Z2H5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epb41l1Q9Z2H5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epb41l1Q9Z2H5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epb41l1Q9Z2H5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epb41l1Q9Z2H5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epb41l1Q9Z2H5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epb41l1Q9Z2H5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epb41l1Q9Z2H5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Epb41l1Q9Z2H5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epb41l1Q9Z2H5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Epb41l1Q9Z2H5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Epb41l1Q9Z2H5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epb41l1Q9Z2H5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epb41l1Q9Z2H5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epb41l1Q9Z2H5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epb41l1Q9Z2H5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epb41l1Q9Z2H5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epb41l1Q9Z2H5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epb41l1Q9Z2H5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epb41l1Q9Z2H5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epb41l1Q9Z2H5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epb41l1Q9Z2H5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epb41l1Q9Z2H5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epb41l1Q9Z2H5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epb41l1Q9Z2H5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epb41l1Q9Z2H5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epb41l1Q9Z2H5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epb41l1Q9Z2H5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epb41l1Q9Z2H5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb41l1Q9Z2H5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epb41l1Q9Z2H5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epb41l1Q9Z2H5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epb41l1Q9Z2H5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epb41l1Q9Z2H5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l1Q9Z2H5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb41l1Q9Z2H5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Epb41l1Q9Z2H5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Epb41l1Q9Z2H5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Epb41l1Q9Z2H5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Epb41l1Q9Z2H5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Epb41l1Q9Z2H5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Epb41l1Q9Z2H5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Epb41l1Q9Z2H5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Epb41l1Q9Z2H5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Epb41l1Q9Z2H5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Epb41l1Q9Z2H5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Epb41l1Q9Z2H5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Epb41l1Q9Z2H5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Epb41l1Q9Z2H5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms