Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Rlbp1Q9Z275 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rlbp1Q9Z275 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rlbp1Q9Z275 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rlbp1Q9Z275 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rlbp1Q9Z275 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rlbp1Q9Z275 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rlbp1Q9Z275 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Rlbp1Q9Z275 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rlbp1Q9Z275 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Rlbp1Q9Z275 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rlbp1Q9Z275 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rlbp1Q9Z275 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rlbp1Q9Z275 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rlbp1Q9Z275 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rlbp1Q9Z275 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rlbp1Q9Z275 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rlbp1Q9Z275 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rlbp1Q9Z275 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rlbp1Q9Z275 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rlbp1Q9Z275 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rlbp1Q9Z275 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rlbp1Q9Z275 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rlbp1Q9Z275 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rlbp1Q9Z275 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Rlbp1Q9Z275 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Rlbp1Q9Z275 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rlbp1Q9Z275 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rlbp1Q9Z275 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rlbp1Q9Z275 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rlbp1Q9Z275 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rlbp1Q9Z275 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rlbp1Q9Z275 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rlbp1Q9Z275 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rlbp1Q9Z275 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rlbp1Q9Z275 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rlbp1Q9Z275 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rlbp1Q9Z275 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rlbp1Q9Z275 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rlbp1Q9Z275 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rlbp1Q9Z275 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rlbp1Q9Z275 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rlbp1Q9Z275 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rlbp1Q9Z275 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rlbp1Q9Z275 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rlbp1Q9Z275 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rlbp1Q9Z275 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rlbp1Q9Z275 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rlbp1Q9Z275 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rlbp1Q9Z275 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Rlbp1Q9Z275 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rlbp1Q9Z275 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rlbp1Q9Z275 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rlbp1Q9Z275 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rlbp1Q9Z275 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rlbp1Q9Z275 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rlbp1Q9Z275 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rlbp1Q9Z275 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rlbp1Q9Z275 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rlbp1Q9Z275 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rlbp1Q9Z275 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rlbp1Q9Z275 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rlbp1Q9Z275 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rlbp1Q9Z275 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rlbp1Q9Z275 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms