Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Cldn6Q9Z262 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Cldn6Q9Z262 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Cldn6Q9Z262 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Cldn6Q9Z262 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Cldn6Q9Z262 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Cldn6Q9Z262 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cldn6Q9Z262 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cldn6Q9Z262 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cldn6Q9Z262 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Cldn6Q9Z262 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Cldn6Q9Z262 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Cldn6Q9Z262 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Cldn6Q9Z262 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Cldn6Q9Z262 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Cldn6Q9Z262 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Cldn6Q9Z262 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Cldn6Q9Z262 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Cldn6Q9Z262 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Cldn6Q9Z262 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Cldn6Q9Z262 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Cldn6Q9Z262 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Cldn6Q9Z262 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Cldn6Q9Z262 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Cldn6Q9Z262 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Cldn6Q9Z262 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Cldn6Q9Z262 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,19■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Cldn6Q9Z262 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,14■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,09■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Cldn6Q9Z262 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Cldn6Q9Z262 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Cldn6Q9Z262 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Cldn6Q9Z262 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Cldn6Q9Z262 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Cldn6Q9Z262 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Cldn6Q9Z262 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Cldn6Q9Z262 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms