Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6aQ9Z101 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pard6aQ9Z101 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pard6aQ9Z101 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pard6aQ9Z101 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6aQ9Z101 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pard6aQ9Z101 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard6aQ9Z101 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pard6aQ9Z101 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pard6aQ9Z101 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pard6aQ9Z101 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pard6aQ9Z101 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pard6aQ9Z101 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard6aQ9Z101 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pard6aQ9Z101 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pard6aQ9Z101 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6aQ9Z101 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pard6aQ9Z101 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pard6aQ9Z101 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pard6aQ9Z101 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6aQ9Z101 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6aQ9Z101 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6aQ9Z101 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pard6aQ9Z101 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard6aQ9Z101 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard6aQ9Z101 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms