Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb6Q9Z0T9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb6Q9Z0T9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb6Q9Z0T9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb6Q9Z0T9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb6Q9Z0T9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb6Q9Z0T9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb6Q9Z0T9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb6Q9Z0T9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itgb6Q9Z0T9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb6Q9Z0T9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb6Q9Z0T9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb6Q9Z0T9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb6Q9Z0T9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb6Q9Z0T9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb6Q9Z0T9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb6Q9Z0T9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb6Q9Z0T9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb6Q9Z0T9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb6Q9Z0T9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb6Q9Z0T9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb6Q9Z0T9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb6Q9Z0T9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb6Q9Z0T9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb6Q9Z0T9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb6Q9Z0T9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb6Q9Z0T9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb6Q9Z0T9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb6Q9Z0T9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb6Q9Z0T9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb6Q9Z0T9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms