Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gipc1Q9Z0G0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gipc1Q9Z0G0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gipc1Q9Z0G0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gipc1Q9Z0G0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gipc1Q9Z0G0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gipc1Q9Z0G0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gipc1Q9Z0G0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gipc1Q9Z0G0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gipc1Q9Z0G0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gipc1Q9Z0G0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gipc1Q9Z0G0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gipc1Q9Z0G0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gipc1Q9Z0G0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gipc1Q9Z0G0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gipc1Q9Z0G0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gipc1Q9Z0G0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gipc1Q9Z0G0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gipc1Q9Z0G0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gipc1Q9Z0G0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gipc1Q9Z0G0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gipc1Q9Z0G0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gipc1Q9Z0G0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gipc1Q9Z0G0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gipc1Q9Z0G0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gipc1Q9Z0G0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gipc1Q9Z0G0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gipc1Q9Z0G0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gipc1Q9Z0G0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gipc1Q9Z0G0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gipc1Q9Z0G0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gipc1Q9Z0G0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gipc1Q9Z0G0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms