Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Stxbp4Q9WV89 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Stxbp4Q9WV89 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Stxbp4Q9WV89 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Stxbp4Q9WV89 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stxbp4Q9WV89 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stxbp4Q9WV89 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Stxbp4Q9WV89 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stxbp4Q9WV89 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stxbp4Q9WV89 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stxbp4Q9WV89 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Stxbp4Q9WV89 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Stxbp4Q9WV89 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Stxbp4Q9WV89 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Stxbp4Q9WV89 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Stxbp4Q9WV89 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stxbp4Q9WV89 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Stxbp4Q9WV89 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Stxbp4Q9WV89 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Stxbp4Q9WV89 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Stxbp4Q9WV89 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Stxbp4Q9WV89 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Stxbp4Q9WV89 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Stxbp4Q9WV89 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Stxbp4Q9WV89 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stxbp4Q9WV89 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Stxbp4Q9WV89 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Stxbp4Q9WV89 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Stxbp4Q9WV89 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Stxbp4Q9WV89 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Stxbp4Q9WV89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Stxbp4Q9WV89 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Stxbp4Q9WV89 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Stxbp4Q9WV89 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Stxbp4Q9WV89 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Stxbp4Q9WV89 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Stxbp4Q9WV89 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Stxbp4Q9WV89 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Stxbp4Q9WV89 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Stxbp4Q9WV89 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Stxbp4Q9WV89 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Stxbp4Q9WV89 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Stxbp4Q9WV89 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Stxbp4Q9WV89 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Stxbp4Q9WV89 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Stxbp4Q9WV89 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Stxbp4Q9WV89 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Stxbp4Q9WV89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,28
Stxbp4Q9WV89 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Stxbp4Q9WV89 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Stxbp4Q9WV89 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Stxbp4Q9WV89 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Stxbp4Q9WV89 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Stxbp4Q9WV89 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stxbp4Q9WV89 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stxbp4Q9WV89 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stxbp4Q9WV89 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Stxbp4Q9WV89 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Stxbp4Q9WV89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46,5 ms