Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB7

Clcnka, Chloride channel protein ClC-Ka, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkaQ9WUB7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClcnkaQ9WUB7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClcnkaQ9WUB7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClcnkaQ9WUB7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClcnkaQ9WUB7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ClcnkaQ9WUB7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClcnkaQ9WUB7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ClcnkaQ9WUB7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClcnkaQ9WUB7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClcnkaQ9WUB7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClcnkaQ9WUB7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClcnkaQ9WUB7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ClcnkaQ9WUB7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClcnkaQ9WUB7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClcnkaQ9WUB7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClcnkaQ9WUB7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClcnkaQ9WUB7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClcnkaQ9WUB7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClcnkaQ9WUB7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClcnkaQ9WUB7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClcnkaQ9WUB7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClcnkaQ9WUB7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClcnkaQ9WUB7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ClcnkaQ9WUB7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClcnkaQ9WUB7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClcnkaQ9WUB7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClcnkaQ9WUB7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClcnkaQ9WUB7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClcnkaQ9WUB7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClcnkaQ9WUB7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClcnkaQ9WUB7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClcnkaQ9WUB7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClcnkaQ9WUB7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClcnkaQ9WUB7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClcnkaQ9WUB7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClcnkaQ9WUB7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ClcnkaQ9WUB7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClcnkaQ9WUB7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClcnkaQ9WUB7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClcnkaQ9WUB7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClcnkaQ9WUB7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ClcnkaQ9WUB7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClcnkaQ9WUB7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClcnkaQ9WUB7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClcnkaQ9WUB7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms