Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ClcnkbQ9WUB6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClcnkbQ9WUB6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ClcnkbQ9WUB6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClcnkbQ9WUB6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClcnkbQ9WUB6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClcnkbQ9WUB6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ClcnkbQ9WUB6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ClcnkbQ9WUB6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ClcnkbQ9WUB6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ClcnkbQ9WUB6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClcnkbQ9WUB6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ClcnkbQ9WUB6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ClcnkbQ9WUB6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClcnkbQ9WUB6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ClcnkbQ9WUB6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ClcnkbQ9WUB6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ClcnkbQ9WUB6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ClcnkbQ9WUB6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ClcnkbQ9WUB6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ClcnkbQ9WUB6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ClcnkbQ9WUB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ClcnkbQ9WUB6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ClcnkbQ9WUB6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ClcnkbQ9WUB6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClcnkbQ9WUB6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClcnkbQ9WUB6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClcnkbQ9WUB6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ClcnkbQ9WUB6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ClcnkbQ9WUB6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ClcnkbQ9WUB6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClcnkbQ9WUB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClcnkbQ9WUB6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClcnkbQ9WUB6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ClcnkbQ9WUB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ClcnkbQ9WUB6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ClcnkbQ9WUB6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClcnkbQ9WUB6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClcnkbQ9WUB6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ClcnkbQ9WUB6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClcnkbQ9WUB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClcnkbQ9WUB6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClcnkbQ9WUB6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ClcnkbQ9WUB6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ClcnkbQ9WUB6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClcnkbQ9WUB6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms