Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab25Q9WTL2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab25Q9WTL2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab25Q9WTL2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab25Q9WTL2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab25Q9WTL2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab25Q9WTL2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab25Q9WTL2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab25Q9WTL2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab25Q9WTL2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab25Q9WTL2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab25Q9WTL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab25Q9WTL2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab25Q9WTL2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms