Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Plod1Q9R0E2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Plod1Q9R0E2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Plod1Q9R0E2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Plod1Q9R0E2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Plod1Q9R0E2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Plod1Q9R0E2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Plod1Q9R0E2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Plod1Q9R0E2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Plod1Q9R0E2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Plod1Q9R0E2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Plod1Q9R0E2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Plod1Q9R0E2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Plod1Q9R0E2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plod1Q9R0E2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Plod1Q9R0E2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Plod1Q9R0E2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plod1Q9R0E2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Plod1Q9R0E2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Plod1Q9R0E2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Plod1Q9R0E2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Plod1Q9R0E2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Plod1Q9R0E2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Plod1Q9R0E2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Plod1Q9R0E2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Plod1Q9R0E2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Plod1Q9R0E2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Plod1Q9R0E2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Plod1Q9R0E2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Plod1Q9R0E2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Plod1Q9R0E2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Plod1Q9R0E2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Plod1Q9R0E2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Plod1Q9R0E2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Plod1Q9R0E2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Plod1Q9R0E2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plod1Q9R0E2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plod1Q9R0E2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plod1Q9R0E2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plod1Q9R0E2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plod1Q9R0E2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plod1Q9R0E2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plod1Q9R0E2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plod1Q9R0E2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plod1Q9R0E2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plod1Q9R0E2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plod1Q9R0E2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Plod1Q9R0E2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms