Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod2Q9R0B9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Plod2Q9R0B9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plod2Q9R0B9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plod2Q9R0B9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plod2Q9R0B9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod2Q9R0B9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod2Q9R0B9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod2Q9R0B9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod2Q9R0B9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod2Q9R0B9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Plod2Q9R0B9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plod2Q9R0B9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plod2Q9R0B9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plod2Q9R0B9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plod2Q9R0B9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plod2Q9R0B9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plod2Q9R0B9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Plod2Q9R0B9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plod2Q9R0B9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plod2Q9R0B9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plod2Q9R0B9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plod2Q9R0B9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod2Q9R0B9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod2Q9R0B9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod2Q9R0B9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod2Q9R0B9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod2Q9R0B9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod2Q9R0B9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod2Q9R0B9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod2Q9R0B9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod2Q9R0B9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plod2Q9R0B9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plod2Q9R0B9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod2Q9R0B9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms