Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubqln2Q9QZM0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubqln2Q9QZM0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubqln2Q9QZM0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubqln2Q9QZM0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubqln2Q9QZM0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubqln2Q9QZM0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubqln2Q9QZM0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubqln2Q9QZM0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubqln2Q9QZM0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubqln2Q9QZM0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubqln2Q9QZM0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubqln2Q9QZM0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubqln2Q9QZM0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubqln2Q9QZM0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubqln2Q9QZM0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubqln2Q9QZM0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubqln2Q9QZM0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubqln2Q9QZM0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubqln2Q9QZM0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubqln2Q9QZM0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubqln2Q9QZM0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubqln2Q9QZM0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubqln2Q9QZM0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubqln2Q9QZM0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubqln2Q9QZM0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubqln2Q9QZM0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms