Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ubqln2Q9QZM0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubqln2Q9QZM0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ubqln2Q9QZM0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ubqln2Q9QZM0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ubqln2Q9QZM0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ubqln2Q9QZM0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubqln2Q9QZM0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubqln2Q9QZM0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubqln2Q9QZM0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubqln2Q9QZM0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubqln2Q9QZM0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubqln2Q9QZM0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubqln2Q9QZM0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubqln2Q9QZM0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ubqln2Q9QZM0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ubqln2Q9QZM0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubqln2Q9QZM0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubqln2Q9QZM0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubqln2Q9QZM0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubqln2Q9QZM0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubqln2Q9QZM0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubqln2Q9QZM0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ubqln2Q9QZM0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubqln2Q9QZM0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubqln2Q9QZM0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubqln2Q9QZM0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubqln2Q9QZM0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubqln2Q9QZM0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubqln2Q9QZM0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubqln2Q9QZM0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubqln2Q9QZM0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubqln2Q9QZM0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ubqln2Q9QZM0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubqln2Q9QZM0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubqln2Q9QZM0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubqln2Q9QZM0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubqln2Q9QZM0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubqln2Q9QZM0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubqln2Q9QZM0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubqln2Q9QZM0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubqln2Q9QZM0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubqln2Q9QZM0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubqln2Q9QZM0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubqln2Q9QZM0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubqln2Q9QZM0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubqln2Q9QZM0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubqln2Q9QZM0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubqln2Q9QZM0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubqln2Q9QZM0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubqln2Q9QZM0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubqln2Q9QZM0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubqln2Q9QZM0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubqln2Q9QZM0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubqln2Q9QZM0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubqln2Q9QZM0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubqln2Q9QZM0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubqln2Q9QZM0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubqln2Q9QZM0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubqln2Q9QZM0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubqln2Q9QZM0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubqln2Q9QZM0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubqln2Q9QZM0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubqln2Q9QZM0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubqln2Q9QZM0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubqln2Q9QZM0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubqln2Q9QZM0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubqln2Q9QZM0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubqln2Q9QZM0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubqln2Q9QZM0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubqln2Q9QZM0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubqln2Q9QZM0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubqln2Q9QZM0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubqln2Q9QZM0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubqln2Q9QZM0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubqln2Q9QZM0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubqln2Q9QZM0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubqln2Q9QZM0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubqln2Q9QZM0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubqln2Q9QZM0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubqln2Q9QZM0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubqln2Q9QZM0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubqln2Q9QZM0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubqln2Q9QZM0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubqln2Q9QZM0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubqln2Q9QZM0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubqln2Q9QZM0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubqln2Q9QZM0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubqln2Q9QZM0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubqln2Q9QZM0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubqln2Q9QZM0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubqln2Q9QZM0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubqln2Q9QZM0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubqln2Q9QZM0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubqln2Q9QZM0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubqln2Q9QZM0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubqln2Q9QZM0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubqln2Q9QZM0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubqln2Q9QZM0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubqln2Q9QZM0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms