Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZI9

Serinc3, Serine incorporator 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serinc3Q9QZI9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serinc3Q9QZI9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serinc3Q9QZI9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serinc3Q9QZI9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serinc3Q9QZI9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serinc3Q9QZI9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Serinc3Q9QZI9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serinc3Q9QZI9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serinc3Q9QZI9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serinc3Q9QZI9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serinc3Q9QZI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Serinc3Q9QZI9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serinc3Q9QZI9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serinc3Q9QZI9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Serinc3Q9QZI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serinc3Q9QZI9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Serinc3Q9QZI9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Serinc3Q9QZI9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serinc3Q9QZI9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serinc3Q9QZI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms