Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn8Q9QZ49 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubxn8Q9QZ49 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubxn8Q9QZ49 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubxn8Q9QZ49 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubxn8Q9QZ49 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ubxn8Q9QZ49 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn8Q9QZ49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ubxn8Q9QZ49 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ubxn8Q9QZ49 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ubxn8Q9QZ49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ubxn8Q9QZ49 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ubxn8Q9QZ49 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ubxn8Q9QZ49 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ubxn8Q9QZ49 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubxn8Q9QZ49 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ubxn8Q9QZ49 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ubxn8Q9QZ49 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ubxn8Q9QZ49 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ubxn8Q9QZ49 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ubxn8Q9QZ49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ubxn8Q9QZ49 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ubxn8Q9QZ49 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ubxn8Q9QZ49 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ubxn8Q9QZ49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ubxn8Q9QZ49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ubxn8Q9QZ49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ubxn8Q9QZ49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ubxn8Q9QZ49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ubxn8Q9QZ49 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubxn8Q9QZ49 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubxn8Q9QZ49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubxn8Q9QZ49 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubxn8Q9QZ49 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ubxn8Q9QZ49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn8Q9QZ49 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn8Q9QZ49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn8Q9QZ49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn8Q9QZ49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms