Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mid2Q9QUS6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mid2Q9QUS6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mid2Q9QUS6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mid2Q9QUS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mid2Q9QUS6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mid2Q9QUS6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mid2Q9QUS6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mid2Q9QUS6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mid2Q9QUS6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mid2Q9QUS6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mid2Q9QUS6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mid2Q9QUS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mid2Q9QUS6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mid2Q9QUS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mid2Q9QUS6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mid2Q9QUS6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mid2Q9QUS6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mid2Q9QUS6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mid2Q9QUS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mid2Q9QUS6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mid2Q9QUS6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mid2Q9QUS6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mid2Q9QUS6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mid2Q9QUS6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mid2Q9QUS6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mid2Q9QUS6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mid2Q9QUS6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms