Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psma6Q9QUM9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psma6Q9QUM9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma6Q9QUM9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma6Q9QUM9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psma6Q9QUM9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psma6Q9QUM9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psma6Q9QUM9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psma6Q9QUM9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psma6Q9QUM9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psma6Q9QUM9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma6Q9QUM9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psma6Q9QUM9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma6Q9QUM9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psma6Q9QUM9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma6Q9QUM9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma6Q9QUM9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma6Q9QUM9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma6Q9QUM9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma6Q9QUM9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma6Q9QUM9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma6Q9QUM9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma6Q9QUM9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma6Q9QUM9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms