Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Acsl4Q9QUJ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Acsl4Q9QUJ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Acsl4Q9QUJ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Acsl4Q9QUJ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Acsl4Q9QUJ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Acsl4Q9QUJ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Acsl4Q9QUJ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Acsl4Q9QUJ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Acsl4Q9QUJ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Acsl4Q9QUJ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Acsl4Q9QUJ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Acsl4Q9QUJ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Acsl4Q9QUJ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Acsl4Q9QUJ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Acsl4Q9QUJ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Acsl4Q9QUJ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Acsl4Q9QUJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Acsl4Q9QUJ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Acsl4Q9QUJ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Acsl4Q9QUJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Acsl4Q9QUJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Acsl4Q9QUJ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Acsl4Q9QUJ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Acsl4Q9QUJ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Acsl4Q9QUJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acsl4Q9QUJ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Acsl4Q9QUJ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Acsl4Q9QUJ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acsl4Q9QUJ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acsl4Q9QUJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acsl4Q9QUJ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acsl4Q9QUJ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acsl4Q9QUJ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acsl4Q9QUJ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Acsl4Q9QUJ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Acsl4Q9QUJ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Acsl4Q9QUJ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Acsl4Q9QUJ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acsl4Q9QUJ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acsl4Q9QUJ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Acsl4Q9QUJ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Acsl4Q9QUJ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Acsl4Q9QUJ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Acsl4Q9QUJ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Acsl4Q9QUJ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Acsl4Q9QUJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Acsl4Q9QUJ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Acsl4Q9QUJ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Acsl4Q9QUJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Acsl4Q9QUJ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Acsl4Q9QUJ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Acsl4Q9QUJ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms