Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Stx6Q9JKK1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Stx6Q9JKK1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Stx6Q9JKK1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Stx6Q9JKK1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Stx6Q9JKK1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Stx6Q9JKK1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Stx6Q9JKK1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Stx6Q9JKK1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Stx6Q9JKK1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Stx6Q9JKK1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Stx6Q9JKK1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Stx6Q9JKK1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Stx6Q9JKK1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Stx6Q9JKK1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Stx6Q9JKK1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Stx6Q9JKK1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Stx6Q9JKK1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Stx6Q9JKK1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Stx6Q9JKK1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Stx6Q9JKK1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Stx6Q9JKK1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Stx6Q9JKK1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Stx6Q9JKK1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Stx6Q9JKK1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Stx6Q9JKK1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Stx6Q9JKK1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Stx6Q9JKK1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Stx6Q9JKK1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Stx6Q9JKK1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Stx6Q9JKK1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Stx6Q9JKK1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Stx6Q9JKK1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Stx6Q9JKK1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Stx6Q9JKK1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Stx6Q9JKK1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Stx6Q9JKK1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Stx6Q9JKK1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Stx6Q9JKK1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Stx6Q9JKK1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Stx6Q9JKK1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Stx6Q9JKK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Stx6Q9JKK1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stx6Q9JKK1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stx6Q9JKK1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Stx6Q9JKK1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Stx6Q9JKK1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Stx6Q9JKK1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Stx6Q9JKK1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Stx6Q9JKK1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stx6Q9JKK1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stx6Q9JKK1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stx6Q9JKK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Stx6Q9JKK1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Stx6Q9JKK1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Stx6Q9JKK1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms