Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a3r2Q9JHL1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3r2Q9JHL1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a3r2Q9JHL1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a3r2Q9JHL1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a3r2Q9JHL1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a3r2Q9JHL1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a3r2Q9JHL1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a3r2Q9JHL1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a3r2Q9JHL1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a3r2Q9JHL1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a3r2Q9JHL1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a3r2Q9JHL1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3r2Q9JHL1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a3r2Q9JHL1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a3r2Q9JHL1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc9a3r2Q9JHL1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3r2Q9JHL1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3r2Q9JHL1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a3r2Q9JHL1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a3r2Q9JHL1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a3r2Q9JHL1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a3r2Q9JHL1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 422.8 ms