Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Slc9a3r2Q9JHL1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc9a3r2Q9JHL1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slc9a3r2Q9JHL1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc9a3r2Q9JHL1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc9a3r2Q9JHL1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc9a3r2Q9JHL1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc9a3r2Q9JHL1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc9a3r2Q9JHL1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc9a3r2Q9JHL1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc9a3r2Q9JHL1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc9a3r2Q9JHL1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc9a3r2Q9JHL1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc9a3r2Q9JHL1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc9a3r2Q9JHL1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc9a3r2Q9JHL1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc9a3r2Q9JHL1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc9a3r2Q9JHL1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc9a3r2Q9JHL1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9a3r2Q9JHL1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc9a3r2Q9JHL1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc9a3r2Q9JHL1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc9a3r2Q9JHL1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc9a3r2Q9JHL1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc9a3r2Q9JHL1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc9a3r2Q9JHL1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc9a3r2Q9JHL1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc9a3r2Q9JHL1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9a3r2Q9JHL1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9a3r2Q9JHL1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9a3r2Q9JHL1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc9a3r2Q9JHL1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc9a3r2Q9JHL1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc9a3r2Q9JHL1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9a3r2Q9JHL1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9a3r2Q9JHL1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3r2Q9JHL1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3r2Q9JHL1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3r2Q9JHL1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3r2Q9JHL1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a3r2Q9JHL1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc9a3r2Q9JHL1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc9a3r2Q9JHL1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a3r2Q9JHL1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc9a3r2Q9JHL1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc9a3r2Q9JHL1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc9a3r2Q9JHL1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc9a3r2Q9JHL1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a3r2Q9JHL1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc9a3r2Q9JHL1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc9a3r2Q9JHL1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc9a3r2Q9JHL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc9a3r2Q9JHL1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc9a3r2Q9JHL1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a3r2Q9JHL1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a3r2Q9JHL1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a3r2Q9JHL1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a3r2Q9JHL1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms