Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 319.02■□□□□ 0.645e-28■■■■■ 43.4
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CSTF2TQ9H0L4 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-13■■■■■ 43.4
CSTF2TQ9H0L4 SSTR5-AS1-205ENST00000624643 1010 nt18.45■□□□□ 0.542e-11■■■■■ 43.2
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-212ENST00000480007 569 ntTSL 410.34□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-206ENST00000449975 555 ntTSL 49.06□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -12e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 58.28□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 36.96□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-204ENST00000418989 663 ntTSL 46.34□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 46.34□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 43
CSTF2TQ9H0L4 UHRF1-202ENST00000613817 1859 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-11■■■■■ 42.9
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CSTF2TQ9H0L4 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-11■■■■■ 42.9
CSTF2TQ9H0L4 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 42.9
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CSTF2TQ9H0L4 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-12■■■■■ 42.9
CSTF2TQ9H0L4 RAB10-203ENST00000473035 571 ntTSL 46.6□□□□□ -1.352e-12■■■■■ 42.9
CSTF2TQ9H0L4 RAB10-202ENST00000462003 584 ntTSL 45.92□□□□□ -1.462e-12■■■■■ 42.9
CSTF2TQ9H0L4 HINFP-205ENST00000527755 2491 ntTSL 210.19□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 42.7
CSTF2TQ9H0L4 AC008543.1-201ENST00000344893 3383 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.993e-12■■■■■ 42.5
CSTF2TQ9H0L4 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 313.46□□□□□ -0.254e-13■■■■■ 42.4
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CSTF2TQ9H0L4 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 39.53□□□□□ -0.884e-13■■■■■ 42.4
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CSTF2TQ9H0L4 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 28.94□□□□□ -0.984e-13■■■■■ 42.4
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-215ENST00000509068 805 ntTSL 320.56■□□□□ 0.884e-9■■■■■ 42.2
CSTF2TQ9H0L4 ZNF638-222ENST00000491843 332 ntTSL 38.13□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 42
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 219.45■□□□□ 0.79e-9■■■■■ 42
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 28.13□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 42
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 513.86□□□□□ -0.192e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.422e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.622e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.712e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.852e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 59.72□□□□□ -0.852e-31■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-31■■■■■ 41.9
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CSTF2TQ9H0L4 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.96■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 41.9
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 218.32■□□□□ 0.524e-30■■■■■ 41.8
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CSTF2TQ9H0L4 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-12■■■■■ 41.5
CSTF2TQ9H0L4 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.032e-12■■■■■ 41.5
CSTF2TQ9H0L4 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-12■■■■■ 41.5
CSTF2TQ9H0L4 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 41.4
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CSTF2TQ9H0L4 YWHAE-204ENST00000486241 691 ntTSL 213.78□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 41.1
CSTF2TQ9H0L4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-10■■■■■ 41.1
CSTF2TQ9H0L4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 41.1
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CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.155e-9■■■■■ 41
CSTF2TQ9H0L4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 40.7
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 40.7
CSTF2TQ9H0L4 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 40.7
CSTF2TQ9H0L4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.23□□□□□ -0.139e-26■■■■■ 40.5
CSTF2TQ9H0L4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.533e-10■■■■■ 40.5
CSTF2TQ9H0L4 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-13■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 517.26■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-224ENST00000561991 964 ntTSL 516.42■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-220ENST00000487932 6464 ntTSL 515.16■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-234ENST00000567946 1822 ntTSL 514.49□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-222ENST00000496574 4419 ntTSL 513.55□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-219ENST00000486339 4443 ntTSL 512.81□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-202ENST00000415938 3386 ntTSL 512.68□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PKD1-216ENST00000483731 4193 ntTSL 511.64□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.353e-11■■■■■ 40.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-210ENST00000574407 497 ntTSL 219.67■□□□□ 0.743e-11■■■■■ 40.1
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-209ENST00000574323 575 ntTSL 413.25□□□□□ -0.293e-11■■■■■ 40.1
CSTF2TQ9H0L4 TJP1-210ENST00000558447 720 ntTSL 324.02■■□□□ 1.444e-9■■■■■ 39.8
CSTF2TQ9H0L4 TJP1-206ENST00000473741 270 ntTSL 23.71□□□□□ -1.824e-9■■■■■ 39.8
CSTF2TQ9H0L4 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 39.17□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 39.8
CSTF2TQ9H0L4 CHPT1-208ENST00000552215 4342 ntTSL 1 (best)7.67□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 39.8
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 516.13■□□□□ 0.176e-9■■■■■ 39.8
CSTF2TQ9H0L4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 39.8
CSTF2TQ9H0L4 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.587e-10■■■■■ 39.7
CSTF2TQ9H0L4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-217ENST00000486653 563 ntTSL 410.75□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 39.6
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