Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slco1c1Q9ERB5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slco1c1Q9ERB5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slco1c1Q9ERB5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slco1c1Q9ERB5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slco1c1Q9ERB5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slco1c1Q9ERB5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slco1c1Q9ERB5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slco1c1Q9ERB5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slco1c1Q9ERB5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slco1c1Q9ERB5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slco1c1Q9ERB5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slco1c1Q9ERB5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slco1c1Q9ERB5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slco1c1Q9ERB5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slco1c1Q9ERB5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slco1c1Q9ERB5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slco1c1Q9ERB5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slco1c1Q9ERB5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Slco1c1Q9ERB5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms