Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tor1aQ9ER39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tor1aQ9ER39 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tor1aQ9ER39 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tor1aQ9ER39 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tor1aQ9ER39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tor1aQ9ER39 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tor1aQ9ER39 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tor1aQ9ER39 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tor1aQ9ER39 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tor1aQ9ER39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tor1aQ9ER39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tor1aQ9ER39 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tor1aQ9ER39 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1aQ9ER39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tor1aQ9ER39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tor1aQ9ER39 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tor1aQ9ER39 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tor1aQ9ER39 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tor1aQ9ER39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tor1aQ9ER39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tor1aQ9ER39 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tor1aQ9ER39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tor1aQ9ER39 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tor1aQ9ER39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tor1aQ9ER39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tor1aQ9ER39 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tor1aQ9ER39 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tor1aQ9ER39 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tor1aQ9ER39 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tor1aQ9ER39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tor1aQ9ER39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tor1aQ9ER39 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tor1aQ9ER39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tor1aQ9ER39 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tor1aQ9ER39 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tor1aQ9ER39 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tor1aQ9ER39 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tor1aQ9ER39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tor1aQ9ER39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tor1aQ9ER39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tor1aQ9ER39 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tor1aQ9ER39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tor1aQ9ER39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms