Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr9Q9EQU3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr9Q9EQU3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr9Q9EQU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr9Q9EQU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr9Q9EQU3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr9Q9EQU3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tlr9Q9EQU3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tlr9Q9EQU3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr9Q9EQU3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr9Q9EQU3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tlr9Q9EQU3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr9Q9EQU3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr9Q9EQU3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr9Q9EQU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr9Q9EQU3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr9Q9EQU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr9Q9EQU3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tlr9Q9EQU3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tlr9Q9EQU3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tlr9Q9EQU3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tlr9Q9EQU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tlr9Q9EQU3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlr9Q9EQU3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlr9Q9EQU3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlr9Q9EQU3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tlr9Q9EQU3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tlr9Q9EQU3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tlr9Q9EQU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tlr9Q9EQU3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tlr9Q9EQU3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tlr9Q9EQU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tlr9Q9EQU3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tlr9Q9EQU3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tlr9Q9EQU3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tlr9Q9EQU3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Tlr9Q9EQU3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tlr9Q9EQU3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tlr9Q9EQU3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tlr9Q9EQU3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tlr9Q9EQU3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tlr9Q9EQU3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tlr9Q9EQU3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tlr9Q9EQU3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tlr9Q9EQU3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr9Q9EQU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms