Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf21Q9EPU5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf21Q9EPU5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf21Q9EPU5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf21Q9EPU5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf21Q9EPU5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf21Q9EPU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfrsf21Q9EPU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf21Q9EPU5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf21Q9EPU5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf21Q9EPU5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf21Q9EPU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf21Q9EPU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfrsf21Q9EPU5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf21Q9EPU5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf21Q9EPU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms