Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCV7

Krt7, Keratin, type II cytoskeletal 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt7Q9DCV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt7Q9DCV7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt7Q9DCV7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt7Q9DCV7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt7Q9DCV7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt7Q9DCV7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt7Q9DCV7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt7Q9DCV7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt7Q9DCV7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt7Q9DCV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt7Q9DCV7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt7Q9DCV7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt7Q9DCV7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt7Q9DCV7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt7Q9DCV7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt7Q9DCV7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt7Q9DCV7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt7Q9DCV7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt7Q9DCV7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt7Q9DCV7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt7Q9DCV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt7Q9DCV7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt7Q9DCV7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt7Q9DCV7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt7Q9DCV7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt7Q9DCV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt7Q9DCV7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt7Q9DCV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt7Q9DCV7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt7Q9DCV7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt7Q9DCV7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt7Q9DCV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt7Q9DCV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt7Q9DCV7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt7Q9DCV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt7Q9DCV7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt7Q9DCV7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt7Q9DCV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt7Q9DCV7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt7Q9DCV7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt7Q9DCV7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt7Q9DCV7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt7Q9DCV7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt7Q9DCV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt7Q9DCV7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt7Q9DCV7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt7Q9DCV7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt7Q9DCV7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms