Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Capn9Q9D805 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Capn9Q9D805 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Capn9Q9D805 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Capn9Q9D805 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Capn9Q9D805 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capn9Q9D805 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capn9Q9D805 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn9Q9D805 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn9Q9D805 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capn9Q9D805 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capn9Q9D805 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn9Q9D805 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn9Q9D805 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn9Q9D805 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Capn9Q9D805 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Capn9Q9D805 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Capn9Q9D805 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Capn9Q9D805 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Capn9Q9D805 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Capn9Q9D805 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Capn9Q9D805 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Capn9Q9D805 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capn9Q9D805 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn9Q9D805 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capn9Q9D805 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capn9Q9D805 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn9Q9D805 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Capn9Q9D805 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Capn9Q9D805 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Capn9Q9D805 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Capn9Q9D805 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capn9Q9D805 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capn9Q9D805 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Capn9Q9D805 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capn9Q9D805 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Capn9Q9D805 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Capn9Q9D805 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Capn9Q9D805 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Capn9Q9D805 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Capn9Q9D805 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Capn9Q9D805 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Capn9Q9D805 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn9Q9D805 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn9Q9D805 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn9Q9D805 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Capn9Q9D805 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn9Q9D805 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Capn9Q9D805 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms