Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
2310002L09RikQ9D7L5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
2310002L09RikQ9D7L5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
2310002L09RikQ9D7L5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
2310002L09RikQ9D7L5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
2310002L09RikQ9D7L5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
2310002L09RikQ9D7L5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
2310002L09RikQ9D7L5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
2310002L09RikQ9D7L5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
2310002L09RikQ9D7L5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
2310002L09RikQ9D7L5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
2310002L09RikQ9D7L5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
2310002L09RikQ9D7L5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
2310002L09RikQ9D7L5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
2310002L09RikQ9D7L5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
2310002L09RikQ9D7L5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
2310002L09RikQ9D7L5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
2310002L09RikQ9D7L5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
2310002L09RikQ9D7L5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
2310002L09RikQ9D7L5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
2310002L09RikQ9D7L5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
2310002L09RikQ9D7L5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
2310002L09RikQ9D7L5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
2310002L09RikQ9D7L5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
2310002L09RikQ9D7L5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
2310002L09RikQ9D7L5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
2310002L09RikQ9D7L5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
2310002L09RikQ9D7L5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
2310002L09RikQ9D7L5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
2310002L09RikQ9D7L5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
2310002L09RikQ9D7L5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
2310002L09RikQ9D7L5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
2310002L09RikQ9D7L5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
2310002L09RikQ9D7L5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
2310002L09RikQ9D7L5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
2310002L09RikQ9D7L5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
2310002L09RikQ9D7L5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
2310002L09RikQ9D7L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
2310002L09RikQ9D7L5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
2310002L09RikQ9D7L5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
2310002L09RikQ9D7L5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
2310002L09RikQ9D7L5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
2310002L09RikQ9D7L5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms