Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930556J24RikQ9D4U7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4930556J24RikQ9D4U7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4930556J24RikQ9D4U7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930556J24RikQ9D4U7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930556J24RikQ9D4U7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930556J24RikQ9D4U7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930556J24RikQ9D4U7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930556J24RikQ9D4U7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930556J24RikQ9D4U7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930556J24RikQ9D4U7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms